吴茱萸一般是在8-9月份果实成熟并且呈橙色的时候即可采收。采收时把果穗成串摘下，在阳光下晾晒，晾干之后揉去果柄并颠去杂质，并在通风处干燥储存。在采收的时候，不要损伤结果的枝条以免影响下一年吴茱萸的产量。
吴茱萸主产江西、浙江、贵州、广西、云南、湖南、湖北、四川、陕西等省。
首先在母株上剪取20 cm左右的小段，且每段上有芽2～3个。其次将枝条小段上端剪平，下端修剪成斜面，插条两端约离芽各1.5 cm。最后放入干净的保鲜袋中，并在保鲜袋中放2个湿棉球，再封住袋口。运输途中要遮住阳光，防止袋中温度过高损坏插条。
吴茱萸研成末用醋敷在脚心对高血压有治疗作用。但各人不一样，有些人效果好，有些人不一定有好的效果。
一般选用的应该是南五味子，北五味子其实药效也差不多。
