蔓枯病是瓜蒌种植过程中常发生的病害，而且症状表现像流胶病，病害严重的情况下会导致茎蔓枯死，一般化学杀菌剂只能杀死表面的病菌，不能渗入到维管束内部杀死内部的病菌，还会导致病菌基数逐年累积，发病越重。很多时候，化学药剂在作物生长的敏感时期不敢用药，一般见症治病，高浓度用药也会造成药害，造成恶性 循环。除在多雨高温情况下易发生外，偏施化学肥料尤其是氮肥，植株徒长、旺长，长势弱。而且大量的化学肥料的施用，导致土壤出现酸化、板结、盐渍化现象，影响根系正常生长，长势衰弱，容易被病菌侵染。
瓜萎喜肥，肥水少了，会引起大量落花落果。因此生长期要加强中耕除草与追肥。整地时施足底肥（圈肥5000千克/亩），栽后第一年，如嫌底肥不足，可在6月间追1次肥。从第二年起，每年追肥2次。第一次在瓜萎茎蔓长出30厘米高时；第二次在6月中旬（开花之前）。均以有机肥为主，每亩用腐熟大粪500~1000千克或豆饼50千克、尿素10~15千克、过磷酸钙15千克及土杂肥，也可施用其他有机肥。在离植株四周约15厘米处开沟，将肥料撒于沟内，填土盖平。施肥后在距植株30厘米处作畦埂，放水浇灌。
种植密度：肥沃的大田一般每亩种植150棵。较差的大田每亩种植200棵。行距3米以上，株距1.5米左右。适时种植：抓住季节，适时种植是种植瓜蒌当年获得收益的关键。一般惊蛰前后十天处理好的块根要下苗圃，清明前后十天秧苗要移栽到大田；否则就很难保证当年有一个好收成了。
栝楼透翅蛾是栝楼的主要害虫。初龄幼虫在栝楼茎表面蛀食，三龄幼虫逐渐钻入茎内取食，并分泌出白色透明的胶状物，和排泄的粪便混在一起，逐渐将茎吃空，并使栝楼茎部逐渐膨大，形成虫癭。轻者影响产量，重者造成绝产。
